Segundo o Compromisso da Irmandade da Santa Casa da Misericórdia de Mortágua, Artigo 13.º.:
“São Corpos Gerentes da Santa Casa da Misericórdia a Assembleia Geral, a Mesa Administrativa e o Conselho Fiscal, também chamado Definitório.”
A Mesa da Assembleia Geral é o órgão deliberativo máximo da Instituição.
A Mesa Administrativa é órgão que dirige e administra os negócios da Instituição, tendo sempre em vista a mais estrita economia.
O Definitório é o órgão que fiscaliza os actos da direcção, examina as contas e respectivos documentos.
Foram eleitos os seguintes Corpos Gerentes, para o quadriénio 2016-2020
Mesa da Assembleia-Geral
Presidente
Vitor Manuel Ferreira Seabra
Vice-Presidente
António Sérgio Agostinho Correia Pinto
Secretária
Maria Celeste Figueiredo
Mesa Administrativa
Provedor
Dr. Vítor Manuel da Fonseca Fernandes
Eusébio Ferreira
Fernando Manuel Borges Portelada
Nelson António Rodrigues Filipe
Maria Teresa Almeida e Sousa Abreu Ferreira Gaspar
Suplente:
José Manuel Mortágua Nunes
Conselho Fiscal ou Definitório
Presidente
José Manuel de Matos Carvalho
Vice-Presidente
João António Cardoso
Secretária
Ivone Oliveira Dinis