Segundo o Compromisso da Irmandade da Santa Casa da Misericórdia de Mortágua, Artigo 13.º.:
“São Corpos Gerentes da Santa Casa da Misericórdia a Assembleia Geral, a Mesa Administrativa e o Conselho Fiscal, também chamado Definitório.”
A Mesa da Assembleia Geral é o órgão deliberativo máximo da Instituição.
A Mesa Administrativa é órgão que dirige e administra os negócios da Instituição, tendo sempre em vista a mais estrita economia.
O Definitório é o órgão que fiscaliza os actos da direcção, examina as contas e respectivos documentos.
Foram eleitos os seguintes Corpos Gerentes, para o quadriénio 2020-2024
Mesa da Assembleia-Geral
Presidente
Urbano Oliveira Marques
Vice-Presidente
António Sérgio Agostinho Correia Pinto
Secretária
Maria Celeste Figueiredo
Mesa Administrativa
Presidente
Dr. Vítor Manuel da Fonseca Fernandes
Vice-Provedor
Dr. Eusébio Ferreira
Tesoureiro
José Manuel Mortágua Nunes
Secretária
Maria Margarida Matos Lourenço
Vogal
Maria Teresa Almeida e Sousa Abreu Ferreira Gaspar
Conselho Fiscal ou Definitório
Presidente
José Manuel de Matos Carvalho
Vice-Presidente
João António Cardoso
Secretária
Ivone Oliveira Dinis